研究院设院长一名、副院长两名：院长负责确定研究院的总体发展方向和重大研究计划，主管研究院的重大事项，作为研究院运行、安全和承担相关任务的第一责任人。副院长协助院长工作，在主任短期离开时，代行院长职能。院长与副院长形成研究院的领导集体，重大事宜集体讨论确定，负责制订中长期科技规划，具体事宜按分工各自负责。

研究院下设办公室，设主任一名，主要负责日常工作管理。